定期的に幹事会を開催し、学会を運営しています。（年３回）
幹事会メンバー（2019年）
- 会長
- 田中秀樹
- 事務局長
- 泰岡顕治
- 編集委員長
- 松林伸幸
- 幹事
- 石山達也 （富山大） アンサンブル編集担当
- 玉井良則 （福井大） ホームページ担当
- 吉井範行 （名古屋大） 討論会担当
分子シミュレーションスクール担当（補佐）
- 北尾彰朗 （東工大） 学術賞担当（主査）
- 鷲津仁志 （兵庫県立大）学術賞担当（補佐）
- 大鳥範和 （新潟大） 書記
- 奥村久士 （分子研） 分子シミュレーションスクール担当（主査）
- 三浦伸一 （金沢大） 学生優秀発表賞担当（主査）
- 志賀基之 （原子力機構）学生優秀発表賞担当（補佐）
- 森田明弘 （東北大） 監査（主査）, 夏の学校担当
- 光武亜代理（明治大） 監査（補佐）
- 小田竜樹 （金沢大） 選挙管理担当（主査）
- 松本充弘 （京都大） 選挙管理担当（補佐）
- 諸星 圭 （旭化成） 産学連携担当
- 松林伸幸 （大阪大） 国際連携担当
- 杉田有治 （理研） 国際連携担当
過去の幹事会