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分子シミュレーション研究会は、コンピュータシミュレーションの手法により分子集合体の物理・化学的性質を求めるための諸問題を研究する、200名以上の会員により構成されています。

分子シミュレーション研究会

The Molecular Simulation Society of Japan

学生優秀発表賞STUDENT PRIZE

分子シミュレーション討論会でエントリーした学生の中から、優秀な発表を選出しています。

第30回分子シミュレーション討論会

(2016年12月, 大阪)
  • 中川 恒 氏 東京大学 物性研究所 分子シミュレーションにおける三体ポテンシャルを含んだ系の局所応力テンソルの非一意性
  • 森 穂高 氏 デンソー, 大阪大学 大学院基礎工学研究科 分子動力学シミュレーションによるナノ空間におけるエポキシ樹脂の充填挙動の解析
  • 清水 洸佑 氏 福井大学 大学院工学研究科 高分子結晶膜のCO2分離性能を単結晶モデルと表面を含むモデルで見る
  • 黒木 菜保子 氏 お茶の水女子大学 大学院人間文化創成科学研究科 [C2mim]BF4イオン液体中で生成するCo(II)(OH2)4錯体周辺の溶媒和構造とソルバトクロミズムに関する理論的研究
  • 佐々木 徹 氏 早稲田大学 先進理工学研究科 疎水表面付近における水の誘電率低下の分子描像
  • 宮﨑 裕介 氏 名古屋大学 大学院工学研究科 分子動力学法を用いた脂質膜における細孔形成過程の自由エネルギー解析
  • 鈴岡 大樹 氏 東北大学 大学院理学研究科 QM/MM-ER法による光化学系IIのMnクラスターにおける一電子酸化反応の自由エネルギー解析

第29回分子シミュレーション討論会

(2015年12月, 新潟)
  • 塚本 修一朗 氏 名古屋大学 大学院理学研究科 拡張アンサンブル分子動力学シミュレーションによるアイソザイム選択的ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤の選択性の解明
  • 馬島 彬 氏 徳島大学 大学院ヘルスバイオサイエンス研究部 分子科学計算を用いた自由エネルギー変化の線形則に基づくトリプシンの触媒反応メカニズムの詳細解析
  • 畑中 佑太 氏 名古屋大学 大学院工学研究科 溶媒和イオン液体のイオン性の解析
  • 吉川 信明 氏 東北大学 大学院理学研究科 界面構造の座標化による油水界面のイオン輸送の解析、及び、拡張系の方法を用いた電位差一定のアンサンブルの実現

第28回分子シミュレーション討論会

(2014年11月, 仙台)
  • 吉川 信明 氏 東北大学 大学院理学研究科 二次元自由エネルギー曲面を用いた液液界面におけるイオン輸送の解析
  • 海野 悟 氏 東北大学 大学院理学研究科 交換ホール関数に基づくQM/MM法における交換反発ポテンシャルの計算
  • 浦野 諒 氏 名古屋大学 大学院理学研究科 決定論的レプリカ交換法とその生体分子のフォールディングシミュレーションへの適用例
  • 鈴木 雄一 氏 名古屋大学 大学院情報科学研究科 芳香族ポリアミド膜合成のアトミスティックシミュレーション:界面重合反応過程における単量体混合比率の膜構造への影響

3rd International Conference on Molecular Simulation(ICMS2013)

(November, 2013, Kobe)
  • 中村 慎 氏 金沢大学 大学院自然科学研究科 Development of Ab-initio Mean-force Dynamics Using a Logarithmic Energy Landscape for Constructing Free-Energy Profiles
  • 緒方 勇大 氏 横浜市立大学 大学院生命ナノシステム科学研究科 Nuclear quantum effect on OH(H2O)2 with ab initio path integral molecular dynamics
  • 小室 靖明 氏 中央大学・理化学研究所 MD simulations of ATP/ADP bound form of Ca2+-ATPase using improved polyphosphate parameters of the CHARMM force field
  • Adnan Hamid 氏 京都大学 大学院工学研究科 Microstructure Analysis of Sedimenting Particles
  • 望月 建爾 氏 総合研究大学院大学 A study for homogeneous melting dynamics of a high pressure polymorph of ice: ice VI

第26回分子シミュレーション討論会

(2012年11月, 福岡)
  • 正尾 裕輔 氏 京都大学 大学院工学研究科 LD-BTE 計算によるフォノン物性および熱伝導のシミュレーション
  • 望月 健爾 氏 総合研究大学院大学 Basin-Hopping 法とRigid Body 法を組み合わせた生体分子のリガンド結合自由エネルギー計算法の開発とAldose Reductase への応用
  • 山内 隆義 氏 名古屋大学 大学院工学研究科 影響汎関数理論を用いた銅基板表面上に吸着されたセシウム原子のフォノンモードの振動緩和の研究
  • 山守 優 氏 東京大学 分子細胞生物学研究所 MuSTAR MD : Temperature Accelerated MD とReplica 交換法を用いたMulti Scale サンプリング手法の開発

第25回分子シミュレーション討論会

(2011年12月, 東京)
  • 平塚 将起 氏 慶應義塾大学 大学院機械工学科 アルコールハイドレートの第一原理分子動力学シミュレーション
  • 大野 公子 氏 名古屋大学 大学院工学研究科 平均力を用いた二次元モデル化シミュレーションによるPOPC二重層膜中でのコレステロール側方配置の研究
  • 樋本 和大 氏 岡山大学 大学院自然科学研究科 プラスチック氷の構造と水素結合ネットワーク
  • 坂牧 隆司 氏 慶應義塾大学 大学院理工学研究科 Direct Coexistence 法を用いた固液または気液平衡の分子シミュレーション
  • 弥永 健太 氏 京都大学 大学院工学研究科 微小液滴の蒸発に関するハイブリッドシミュレーション
  • 佐藤 竜馬 氏 名古屋大学 大学院理学研究科 青色光受容体蛋白質のDNA光補修反応メカニズムの理論的研究
  • 岩岡 伸之 氏 慶應義塾大学 理工学部 物理学科 孤立デンドリマーの緩和

第24回分子シミュレーション討論会

(2010年11月, 福井)
  • 佐藤 昴人 氏 早稲田大学 理工学術院 先進理工学研究科 ミオシン周囲の溶媒のアロステリック応答
  • 川本 周平 氏 金沢大学 自然科学研究科 膜透過ペプチドの脂質二重膜透過における自由エネルギー障害
  • 伊藤 太一 氏 名古屋大学 大学院工学研究科 DPPC脂質二重層膜における水分子の膜透過自由エネルギーの経路依存性
  • 原田 隆平 氏 東京大学 大学院理学系研究科 物理学専攻 マルチスケールシミュレーションで探る生体分子の自由エネルギー地形
  • 野口 威照 氏 山口大学 大学院理工学研究科 散逸粒子動力学法によるベシルク変形のダイナミクス
  • 藤本 和士 氏 名古屋大学 工学研究科 メタンのSDSミセルへの可溶化自由エネルギープロフィール計算

第23回分子シミュレーション討論会

(2009年12月, 名古屋)
  • 金子 敏宏 氏 慶應義塾大学 大学院理工学研究科 開放環境科学専攻 Isobaric-Multithermalアンサンブルによるスリット細孔に閉じ込められたLennard-Jones粒子の固液相転移の解明
  • 森 義治 氏 名古屋大学 大学院理学研究科 物質理学専攻 レプリカ交換分子動力学法における適切なスケーリング法
  • 桜庭 俊 氏 東京大学 分子細胞生物学研究所 創生研究分野 独立部分空間分析によるタンパク質集団運動の解析
  • 塚本 貴志 氏 豊橋技術科学大学 知識情報工学科 量子輸送理論に基づく金電極間の人工核酸塩基を含むDNA二重鎖の電気伝導特性の解析
  • 石崎 麻利央 氏 岡山大学 大学院自然科学研究科 Lennard-Jones混合溶液の疎溶媒効果
  • 水口 朋子 氏 九州大学 大学院理学府 物理学専攻 2次元単成分単純液体のガラス転移とポリアモルフィズム

第22回分子シミュレーション討論会

(2008年11月, 岡山)
  • 伊藤 篤史 氏 名古屋大学 大学院理学研究科 物理学専攻 水素原子スパッタリングのグラファイト表面
  • 近藤 寛子 氏 東京大学 新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻 Investigation of Domain Motions in Proteins by Molecular Dynamics Simulations
  • 緒方 祐介 氏 山口大学 大学院理工学研究科 自然科学基盤系学域 生体膜上における脂質ドメインの融合・分裂ダイナミクス
  • 竹中 奨 氏 大阪府立大学 大学院工学研究科 機械系専攻 MDとLBMによるマイクロ多孔体内流れのシミュレーション
  • 渡辺 宙志 氏 名古屋大学 大学院理学研究科 物理学専攻 バクテリオロドプシンのO 中間体の構造モデリング
  • 湊谷 圭祐 氏 慶應義塾大学 大学院理工学研究科 開放環境科学専攻 ギブスアンサンブルモンテカルロ法を用いたメタンハイドレート/メタンガスの二相平衡シミュレーション

第21回分子シミュレーション討論会

(2007年11月, 金沢)
  • 坂牧 隆司 氏 慶應義塾大学 大学院理工学研究科 開放環境科学専攻 ビデオゲーム用ハードウエアを用いた高速分子動力学シミュレーション
  • 中本 淳嗣 氏 金沢大学 大学院自然科学研究科 二成分密度汎関数法による固体中陽電子寿命の計算
  • 辻川 雅人 氏 金沢大学 大学院自然科学研究科 白金表面上に担持された鉄鎖の電子状態と磁気異方性
  • 高柳 昌芳 氏 名古屋大学 大学院情報科学研究科 光解離MbCOにおけるグロビン部内余剰振動エネルギー緩和経路の理論的研究
  • 太田 憲良 氏 金沢大学 大学院自然科学研究科 ジャングルジム型ゲルのブラウニアンダイナミクスシミュレーションによる解析
  • 高岩 大輔 氏 岡山大学 大学院自然科学研究科 準一次元系における水の構造と相挙動

バナースペース

分子シミュレーション研究会
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